Yo, la verdad, es que apenas utilizo las redes P2P, pero por lo que he visto no hay gran diferencia entre emule de windows y amule de mac, salvo poder utilizar el UPNP para redireccionar los puertos. Por lo demas utilizan las mismas redes e2k y kad.
Para torrents utilizo Trasmission y la verdad va muy bien, a pesar de lo simplisima que es su interfaz.
Saludos.

Gigabyte GA-P35-DS3R, Intel Core2 Quad a 2,4, 4 Gb RAM, Audio ALC889a, GeForce 8500 GT 512, 320+320 Gb. S-ATA internos, 320+250+250+160 Gb USB externos. Win Vista 64, Retail 10.5.5, Ubuntu 8.10 64.
Acer Aspire One 1GB. 120GB Wifi Dell DW1390. Vista 32, Ubuntu 8.10, Leopard MsiWind 10.5.5 (kernel vanilla).